La Asociación Colombiana de programas de Bacteriología establece el plan estratégico de la Asociación, el cual define las directrices generales para el desarrollo, y orienta el proceso de la organización durante el período de 1997-2002. El plan se determina a partir de la misión, del objeto y de los principios generales.  Estas afirmaciones que la identifican y su filosofía disciplinar, contituyen las bases estratégicas de Aprobac.

Las grandes áreas en las cuales de desempeñara Aprobac y que aquí se les da el nombre de sectores estratégicos son :